Ähm, ich glaub, ich weiß es...
Und zwar ist das Keine VErmutung, sondern eine Aussage von Tolkien selbst!
Im Jahre 1962 veröffentlichte Tolkien nämlich tatsächlich das Buch
The Adventures of Tom Bombadil Und die Antwort ist sogar schon im Vorwort dieses Buches zu finden.
Dort wird über die Entstehung der Welt in Tolkiens Geschichten geschrieben, und auch über die Götter und Halbgötter. Zuerst werden die Götter (Valar) dann die Halbgötter (Maiar) aufgezählt. Hier das alles entscheidende Zitat:
Die Maiar waren wesentlich zahlreicher: [...]Gothmog der Herr der Balrogs; Sauron, der Herr der Ringe; Thuringwethil, die Fledermaus; Ungolianth, die Spinne; Drauglin, der Werwolf; Goldbeere, die Flußtochter; Iarwain Ben-adar (Tom Bombadil); und die Fünf Zauberer [...]
Tom Bombadil ist also ein Maiar, ein Halbgott. Genau wie seine Goldbeere, um auf Blashers Frage zu antworten.
Das erklärt auch, wieso Sauron ihm nichts anhaben könne!
Meine persönliche Vermutung bevor ich das Buch gelesen habe war aber, das das die inoffizielle Mischung aus Ent und Zwerg war (wie wir alle wissen, die ersten Geschöpfe auf Mittelerde) Dann aber irgendwie verworfen wurde