Nunu wird kaum noch gejunglet, eben aus den Gründen die du genannt hast.^^
Wenn man ihn benutzt, bentuzt man ihn meist in Kombination mit Kayle oder Caitlyn. Gründe sind, sein w,e,r.

Alles gute Fähigkeiten um sie zu beschützen und um ihnen zu helfen am Anfang früh einen Turm kaputt zu machen.
Meist wird Nunu für eine "Fast push"-Strategie verwendet. Im MG-LG wird er immer relativ schwach, aber mit seinem w kann man am Anfang sehr schnell Türme zerstören. (deshalb Caitlyn)
Egal wie man baut, es wird immer so sein, dass er ein EG-Champ ist und später schwach ist.^^ Als Full AP hält er kaum was aus und man kann zwar sehr lustige Momente mit seiner Ulti hinlegen, jedoch kann der Gegner (wenn er gut ist) da ausweichen. Dementsprechend wird er dann meist als Support Tank gebaut, also Sightstone, Aegis, usw. Damit kann man immer seinem Team helfen Sicht zu bekommen, was auch der eigenen Ulti hilft, (wenn man weiß wo die Gegner sind kann man besser einen Hinterhalt vorbereiten) ebenso werden die Boni, die man seinen Verbündeten gibt nochmal stärker, da man noch besser fliehen kann und noch besser Türme angreifen kann. Da Aegis meist auch eher ein MG Gegenstand ist, hilft er auch der Strategie schnell viele Türme zu bekommen. Man darf bei Nunu nicht erwarten, dass er im Alleingang groß was macht, er wird vor allem wegen der Mobilität, dem slow und dem as-buff benutzt.
Ganken ist meine Meinung nach mit das wichtigste bei Nunu. Warum nicht counterjunglen?
Er ist zwar schnell, jedoch kann er nicht über Wälle drüber springen, wodruch der gegnerische Jungler (und die meisten können das), gut vor Nunu fliehen kann oder ihn auch gut einholen kann. Ebenso ist Nunu im 1vs1 unterlegen.
Früher war er ein guter Counterjungler, jedoch gibt es mMn in der Zwischenzeit zu viele Helden, die ihn kontern. Eine Shyvana im Jungle tötet ihn einfach und kann mit der Ulti seine Ulti unterbrechen und ihm wunderbar hinterherspringen. Dementsprechend lohnt sich Counterjunglen gegen sie nicht so sehr. Ebenso kann sie besser counterjunglen, da sie sleber auch einen Speedbuff hat und zudem noch wegspringen kann.^^ Jarvan und Khazix sind beide ebenfalls stark im 1vs1 und können beide wegspringen. Darum sind beides auch gute Counterjungler. (ebenso können alle 3, genauso wie Nunu einem einzelnen Creep schnell viel Leben abziehen, deshalb hat er da keinen Vorteil)
Es gibt noch weitere, aber diese sind mir gerade eingefallen.^^
Auf der Lane kann er eben einem verbündeten Champion helfen schnell einen Turm zu pushen und falls der gegnerische Jungler kommt, ebenfalls helfen schnell zu entkommen.
Nunu ist allgemein sehr vom Team abhängig, alleine kann er nichts. Zudem kann er gut ganken, wenn der Gegner selber pusht - schnell reinrennen (dank w ist man so schnell, dass der Gegner kaum Zeit hat zu reagieren) und dann den Gegner erst Mal slowen. Es ist nicht so stark wie ein Stun, aber wenn dann evtl. der Verbündete noch einen Slow oder sogar einen Stun trifft (was bei dem starken Nunu so einfach möglich ist), dann sollte der Gegner nicht mehr wegkommen.
Das wichtigste ist aber:
NUnu-Bot Skin kaufen und durchgängig Sprüche spammen, wenn man vor Gegnern ist. Das treibt sie zur Weißglut und sie werden anfangen nur dich anzugreifen.