Ich nehme mal an, dass sie (wie viele andere Mythenwesen in Tolkiens Welt) nach und nach ausgestorben sind/aussterben, denn die Ents (Entmänner) hatten die Entfrauen vor Unzeiten verloren, womit jedwede Fortpflanzung unmöglich wurde.
Was man noch zu den Ents sagen kann, ist, dass sie nach dem Ringkrieg nicht nur im Fangornwald, sondern auch in Isengard vorkamen, das sie im Namen des Königs des wiedervereinigten Königreichs verwalteten.